MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 25033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011988	TTTG	2	8	78202	78209	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_011988	CTC	2	6	78271	78276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1503	NC_011988	TTTTG	2	10	78333	78342	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_011988	AAT	2	6	78427	78432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_011988	TCA	2	6	78547	78552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106198
1506	NC_011988	GCC	2	6	78572	78577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106198
1507	NC_011988	CTG	2	6	78601	78606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106198
1508	NC_011988	CA	3	6	78623	78628	50 %	0 %	0 %	50 %	222106198
1509	NC_011988	CGA	2	6	78656	78661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106198
1510	NC_011988	ATG	2	6	78760	78765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106198
1511	NC_011988	TGA	2	6	78772	78777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106198
1512	NC_011988	GTG	2	6	78789	78794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106198
1513	NC_011988	TGT	2	6	78919	78924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106198
1514	NC_011988	GCT	2	6	78926	78931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106198
1515	NC_011988	CAA	2	6	78938	78943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106198
1516	NC_011988	ATT	2	6	78957	78962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106198
1517	NC_011988	CCA	2	6	78970	78975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106198
1518	NC_011988	AT	3	6	79043	79048	50 %	50 %	0 %	0 %	222106198
1519	NC_011988	GC	3	6	79110	79115	0 %	0 %	50 %	50 %	222106198
1520	NC_011988	TC	3	6	79209	79214	0 %	50 %	0 %	50 %	222106198
1521	NC_011988	GTG	2	6	79263	79268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106198
1522	NC_011988	TGA	2	6	79297	79302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106198
1523	NC_011988	CAT	2	6	79316	79321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106198
1524	NC_011988	TGC	2	6	79375	79380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106198
1525	NC_011988	GCC	2	6	79383	79388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106198
1526	NC_011988	AAGG	2	8	79455	79462	50 %	0 %	50 %	0 %	222106198
1527	NC_011988	GCC	3	9	79494	79502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106198
1528	NC_011988	TGA	2	6	79507	79512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106198
1529	NC_011988	TCA	2	6	79696	79701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106198
1530	NC_011988	TGG	2	6	79764	79769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106198
1531	NC_011988	CATT	2	8	79801	79808	25 %	50 %	0 %	25 %	222106198
1532	NC_011988	AGA	2	6	79855	79860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106198
1533	NC_011988	GGTG	2	8	79889	79896	0 %	25 %	75 %	0 %	222106198
1534	NC_011988	GGCCAA	2	12	79913	79924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106198
1535	NC_011988	CATC	2	8	79941	79948	25 %	25 %	0 %	50 %	222106198
1536	NC_011988	GAA	2	6	80010	80015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106199
1537	NC_011988	TCC	2	6	80037	80042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106199
1538	NC_011988	GGC	2	6	80061	80066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106199
1539	NC_011988	CA	3	6	80137	80142	50 %	0 %	0 %	50 %	222106199
1540	NC_011988	CAC	2	6	80151	80156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106199
1541	NC_011988	ACC	2	6	80192	80197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106199
1542	NC_011988	GGATT	2	10	80308	80317	20 %	40 %	40 %	0 %	222106199
1543	NC_011988	GATC	2	8	80331	80338	25 %	25 %	25 %	25 %	222106199
1544	NC_011988	CAT	2	6	80377	80382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106199
1545	NC_011988	CGG	2	6	80412	80417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106199
1546	NC_011988	CGC	2	6	80457	80462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106199
1547	NC_011988	GTGG	2	8	80532	80539	0 %	25 %	75 %	0 %	222106199
1548	NC_011988	TGCGG	2	10	80637	80646	0 %	20 %	60 %	20 %	222106199
1549	NC_011988	CAC	2	6	80654	80659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106199
1550	NC_011988	GCC	2	6	80716	80721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106199
1551	NC_011988	GAA	2	6	80725	80730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106199
1552	NC_011988	TTCA	2	8	80827	80834	25 %	50 %	0 %	25 %	222106199
1553	NC_011988	A	6	6	80861	80866	100 %	0 %	0 %	0 %	222106199
1554	NC_011988	TTC	2	6	80872	80877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106199
1555	NC_011988	TTG	2	6	80903	80908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106199
1556	NC_011988	GGT	2	6	80988	80993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106199
1557	NC_011988	CCT	2	6	81077	81082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106199
1558	NC_011988	GCC	2	6	81334	81339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106199
1559	NC_011988	CGA	2	6	81359	81364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_011988	TGG	2	6	81428	81433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106200
1561	NC_011988	TCA	2	6	81446	81451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106200
1562	NC_011988	TTG	2	6	81589	81594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106200
1563	NC_011988	GGTG	2	8	81633	81640	0 %	25 %	75 %	0 %	222106200
1564	NC_011988	CTG	2	6	81691	81696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106200
1565	NC_011988	TGCC	2	8	81699	81706	0 %	25 %	25 %	50 %	222106200
1566	NC_011988	GCC	2	6	81733	81738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106200
1567	NC_011988	GGC	2	6	81789	81794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106200
1568	NC_011988	TGGCT	2	10	81811	81820	0 %	40 %	40 %	20 %	222106200
1569	NC_011988	TCA	2	6	81949	81954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106200
1570	NC_011988	GAT	2	6	82003	82008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106200
1571	NC_011988	CCGC	2	8	82019	82026	0 %	0 %	25 %	75 %	222106200
1572	NC_011988	TGC	2	6	82055	82060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106200
1573	NC_011988	GAA	2	6	82071	82076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106200
1574	NC_011988	GTG	2	6	82099	82104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106200
1575	NC_011988	CTG	2	6	82190	82195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106200
1576	NC_011988	CTG	2	6	82288	82293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106200
1577	NC_011988	TGA	2	6	82315	82320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106200
1578	NC_011988	CGC	2	6	82351	82356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106201
1579	NC_011988	GCC	2	6	82381	82386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106201
1580	NC_011988	TGC	2	6	82438	82443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106201
1581	NC_011988	CCG	2	6	82512	82517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106201
1582	NC_011988	T	6	6	82665	82670	0 %	100 %	0 %	0 %	222106201
1583	NC_011988	GAT	2	6	82709	82714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106201
1584	NC_011988	TTC	2	6	82729	82734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106201
1585	NC_011988	CAC	2	6	82772	82777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106201
1586	NC_011988	ATC	2	6	82782	82787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106201
1587	NC_011988	CCA	2	6	82894	82899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106201
1588	NC_011988	CA	4	8	82898	82905	50 %	0 %	0 %	50 %	222106201
1589	NC_011988	TGC	2	6	82921	82926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106201
1590	NC_011988	CAT	2	6	83114	83119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106201
1591	NC_011988	TC	3	6	83120	83125	0 %	50 %	0 %	50 %	222106201
1592	NC_011988	TCG	2	6	83143	83148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106201
1593	NC_011988	CCG	2	6	83276	83281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106202
1594	NC_011988	ATC	2	6	83318	83323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106202
1595	NC_011988	AGA	2	6	83350	83355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106202
1596	NC_011988	GGC	2	6	83429	83434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106202
1597	NC_011988	CCG	2	6	83505	83510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106202
1598	NC_011988	TGG	2	6	83601	83606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106202
1599	NC_011988	ACA	2	6	83679	83684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106202
1600	NC_011988	GCCA	2	8	83714	83721	25 %	0 %	25 %	50 %	222106202
1601	NC_011988	TCA	2	6	83724	83729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106202
1602	NC_011988	GAT	2	6	83794	83799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106202
1603	NC_011988	CAT	2	6	83902	83907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106202
1604	NC_011988	GAAGAC	2	12	83909	83920	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	222106202
1605	NC_011988	GCGCT	2	10	83938	83947	0 %	20 %	40 %	40 %	222106202
1606	NC_011988	CCT	2	6	83985	83990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106202
1607	NC_011988	CCA	3	9	84096	84104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106202
1608	NC_011988	GGT	2	6	84142	84147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106202
1609	NC_011988	GCC	2	6	84344	84349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106202
1610	NC_011988	GCC	2	6	84523	84528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106203
1611	NC_011988	CTG	2	6	84578	84583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106203
1612	NC_011988	GAT	2	6	84644	84649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106203
1613	NC_011988	CGC	2	6	84654	84659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106203
1614	NC_011988	CGCC	2	8	84676	84683	0 %	0 %	25 %	75 %	222106203
1615	NC_011988	ATG	2	6	84714	84719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106203
1616	NC_011988	ATC	2	6	84795	84800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106203
1617	NC_011988	GGTT	2	8	84874	84881	0 %	50 %	50 %	0 %	222106203
1618	NC_011988	CT	3	6	84950	84955	0 %	50 %	0 %	50 %	222106204
1619	NC_011988	CCG	2	6	84993	84998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106204
1620	NC_011988	TGG	2	6	85068	85073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106204
1621	NC_011988	AC	5	10	85076	85085	50 %	0 %	0 %	50 %	222106204
1622	NC_011988	GCT	2	6	85158	85163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106204
1623	NC_011988	TGC	2	6	85174	85179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106204
1624	NC_011988	CGA	2	6	85225	85230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106204
1625	NC_011988	GGC	2	6	85290	85295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106204
1626	NC_011988	CCAGCA	2	12	85374	85385	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	222106204
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1752	NC_011988	TCT	2	6	92399	92404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106210
1753	NC_011988	GCA	2	6	92457	92462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106210
1754	NC_011988	GC	3	6	92520	92525	0 %	0 %	50 %	50 %	222106210
1755	NC_011988	A	6	6	92597	92602	100 %	0 %	0 %	0 %	222106210
1756	NC_011988	CGG	2	6	92652	92657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106210
1757	NC_011988	CATG	2	8	92684	92691	25 %	25 %	25 %	25 %	222106210
1758	NC_011988	CGA	2	6	92696	92701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106210
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1832	NC_011988	GAT	2	6	96413	96418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1833	NC_011988	TGA	2	6	96489	96494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106213
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1860	NC_011988	AG	3	6	98042	98047	50 %	0 %	50 %	0 %	222106213
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1862	NC_011988	GA	4	8	98146	98153	50 %	0 %	50 %	0 %	222106213
1863	NC_011988	GATT	2	8	98200	98207	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1864	NC_011988	AAT	2	6	98255	98260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1866	NC_011988	CTG	2	6	98295	98300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106214
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1869	NC_011988	TTCG	2	8	98409	98416	0 %	50 %	25 %	25 %	222106214
1870	NC_011988	GAC	2	6	98438	98443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106214
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1872	NC_011988	GCGCG	2	10	98499	98508	0 %	0 %	60 %	40 %	222106214
1873	NC_011988	TGA	2	6	98531	98536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106214
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1878	NC_011988	GCG	2	6	98750	98755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106214
1879	NC_011988	GCA	2	6	98766	98771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106214
1880	NC_011988	GCAA	2	8	98775	98782	50 %	0 %	25 %	25 %	222106214
1881	NC_011988	TCG	2	6	98785	98790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106214
1882	NC_011988	CGA	2	6	98819	98824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106214
1883	NC_011988	TTGCC	2	10	98825	98834	0 %	40 %	20 %	40 %	222106214
1884	NC_011988	GCG	2	6	98839	98844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106214
1885	NC_011988	CGG	2	6	98850	98855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106214
1886	NC_011988	CGG	2	6	98876	98881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106214
1887	NC_011988	GGC	2	6	98948	98953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106214
1888	NC_011988	TGC	2	6	98974	98979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106214
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1893	NC_011988	CTC	2	6	99500	99505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106215
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1895	NC_011988	GC	3	6	99539	99544	0 %	0 %	50 %	50 %	222106215
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1899	NC_011988	TGG	2	6	99639	99644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106215
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1901	NC_011988	CAG	2	6	99760	99765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106215
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1903	NC_011988	CGA	2	6	99798	99803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106215
1904	NC_011988	TCA	2	6	99806	99811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106215
1905	NC_011988	CCAG	2	8	99835	99842	25 %	0 %	25 %	50 %	222106215
1906	NC_011988	CGT	2	6	99852	99857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106215
1907	NC_011988	CAA	2	6	99882	99887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106215
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1910	NC_011988	ACA	2	6	99988	99993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1911	NC_011988	CGG	2	6	100009	100014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1912	NC_011988	CAG	2	6	100059	100064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106216
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1944	NC_011988	GTC	2	6	101056	101061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106216
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1951	NC_011988	GAT	2	6	101189	101194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106216
1952	NC_011988	AACGCG	2	12	101196	101207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106216
1953	NC_011988	TCG	2	6	101298	101303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106217
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1955	NC_011988	TCGC	2	8	101480	101487	0 %	25 %	25 %	50 %	222106217
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1962	NC_011988	TGCT	2	8	101987	101994	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1963	NC_011988	TG	3	6	102108	102113	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1964	NC_011988	GAT	2	6	102135	102140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1965	NC_011988	ATG	2	6	102396	102401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106218
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1967	NC_011988	GGCC	2	8	102445	102452	0 %	0 %	50 %	50 %	222106218
1968	NC_011988	AG	3	6	102478	102483	50 %	0 %	50 %	0 %	222106218
1969	NC_011988	CGATC	2	10	102508	102517	20 %	20 %	20 %	40 %	222106218
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1972	NC_011988	TATCG	2	10	102584	102593	20 %	40 %	20 %	20 %	222106218
1973	NC_011988	GATC	2	8	102624	102631	25 %	25 %	25 %	25 %	222106218
1974	NC_011988	GTC	2	6	102683	102688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106218
1975	NC_011988	GTC	2	6	102872	102877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1976	NC_011988	CGT	2	6	102942	102947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106219
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1978	NC_011988	GCT	2	6	102979	102984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106219
1979	NC_011988	CAT	2	6	102996	103001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106219
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1981	NC_011988	TTG	2	6	103198	103203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106219
1982	NC_011988	TGA	2	6	103250	103255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106219
1983	NC_011988	CGA	2	6	103257	103262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106219
1984	NC_011988	TGA	2	6	103415	103420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106219
1985	NC_011988	TTG	2	6	103501	103506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106219
1986	NC_011988	GC	3	6	103535	103540	0 %	0 %	50 %	50 %	222106219
1987	NC_011988	GCA	2	6	103559	103564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106219
1988	NC_011988	TGAT	2	8	103633	103640	25 %	50 %	25 %	0 %	222106219
1989	NC_011988	GCA	2	6	103799	103804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106219
1990	NC_011988	CAT	2	6	103827	103832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106219
1991	NC_011988	ATG	2	6	103879	103884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106219
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1993	NC_011988	CGA	2	6	103988	103993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106219
1994	NC_011988	CAA	2	6	104084	104089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106219
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1996	NC_011988	GAT	2	6	104175	104180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106219
1997	NC_011988	TTC	2	6	104182	104187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106219
1998	NC_011988	ATG	2	6	104239	104244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106219
1999	NC_011988	AGC	2	6	104284	104289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106220
2000	NC_011988	TGC	2	6	104369	104374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106220

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